Il conte Rasso, antenato dei conti di Andechs, probabilmente nel X secolo portò al castello di Andechs preziose reliquie di Gesù e dei Santi da un pellegrinaggio in Terra Santa.

A partire dal 1128, il conte Berthold II di Andechs obbligò i suoi sudditi a venerare le reliquie qui conservate, il cosiddetto "Tesoro". Gli eventi politici portarono al declino della dinastia dei conti a partire dal XIII secolo. Nel 1246, il castello di Andechs fu raso al suolo ad eccezione della cappella del castello: il "Tesoro delle Reliquie" fu considerato perso.

Nel tardo Medioevo, Andechs era uno dei tre principali luoghi di pellegrinaggio in Germania, insieme ad Aquisgrana e Treviri. Anche ad Andechs ebbe luogo la cosiddetta "istruzione" delle reliquie, affinché i pellegrini potessero vedere e venerare le reliquie e invocare l'intercessione dei rispettivi santi. Dato che la Chiesa del pellegrinaggio era spesso troppo piccola per il gran numero di pellegrini, le reliquie venivano mostrate per la venerazione dall’erker della facciata sud della chiesa, l'attuale cappella di Edvige.

Per l’"istruzione" delle reliquie si intonavano preghiere, canti e litanie, a seconda che si trattasse di una reliquia di Gesù, come un frammento della corona di spine di Cristo, o della reliquia di un martire. I pellegrini aspettavano pazientemente sulla piazza davanti alla chiesa, il cosiddetto Herrenhof, spesso per ore.

Il tipo e le modalità di venerazione del "Tesoro", come pure la posizione delle reliquie nel culto cristiano in generale, cambiarono nel corso dei secoli.

Nei secoli XVI e XVII Andechs si sviluppò anche come luogo di pellegrinaggio mariano, per cui oltre alle reliquie e alle Tre Sacre Ostie si venerava anche la Madonna.

Lo testimonia ancora oggi l'immagine miracolosa sull'Altare Maggiore inferiore con la Madonna in trono e il Bambino Gesù.

Con la dissoluzione del monastero nel 1803 cominciarono decenni movimentati per il pellegrinaggio. Tuttavia, a causa della sua importanza, continuò ad esistere e ebbe una ripresa dopo il 1850. Per esempio, nel 1907 fu celebrato solennemente il 700° anniversario della nascita di Santa Elisabetta di Turingia (della dinastia Andechs-Merania). La processione delle reliquie fu accompagnata dal vescovo di Eichstätt, dagli abati di Scheyern, Metten, Ettal e St. Ottilien e da membri della famiglia reale bavarese.

Dopo la Seconda Guerra Mondiale, la venerazione di Sant'Edvige si aggiunse al pellegrinaggio. Per i molti sfollati, soprattutto dalla Slesia, Andechs come luogo di nascita della santa divenne un punto di riferimento importante della vecchia patria, tanto più che una reliquia del cranio di Sant'Edvige si trova ad Andechs dal 1924.